Curso El río Huaytará nace en las alturas de la Cordillera Occidental de los Andes, en una zona de lagunas y bofedales ubicada por encima de los 4.000-4.500 m, dentro del distrito de Quito-Arma y áreas circundantes de la provincia de Huaytará. Su curso sigue una dirección general de este a oeste (descendiendo hacia el océano Pacífico), y es típicamente torrentoso y encajonado, labrando un valle interandino estrecho.